Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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FOXC1Q12948 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
FOXC1Q12948 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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