Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RIPPLY1Q0D2K3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms