Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PDE4DQ08499 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms