Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CACNB2Q08289 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms