Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSG1Q02413 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms