Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MDM2Q00987 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms