Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CDK16Q00536 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms