Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG7P83436 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG7P83436 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COG7P83436 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG7P83436 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG7P83436 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG7P83436 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG7P83436 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG7P83436 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG7P83436 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms