Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMF1P82094 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMF1P82094 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms