Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ERVK-21P61565 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms