Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
LINC01547P58512 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms