Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPK4P57078 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms