Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GEMP55040 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GEMP55040 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GEMP55040 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms