Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HK3P52790 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HK3P52790 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HK3P52790 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms