Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KPNA1P52294 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms