Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BRCA2P51587 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRCA2P51587 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms