Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CASP4P49662 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CASP4P49662 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms