Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GCLMP48507 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms