Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HOXD12P35452 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms