Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TSPOP30536 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TSPOP30536 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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