Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DUSP1P28562 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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