Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SP100P23497 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SP100P23497 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SP100P23497 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms