Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HRCP23327 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HRCP23327 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HRCP23327 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HRCP23327 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms