Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCLP18206 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VCLP18206 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VCLP18206 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VCLP18206 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VCLP18206 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms