Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DESP17661 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DESP17661 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
DESP17661 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms