Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HOXB9P17482 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms