Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBTFP17480 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBTFP17480 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBTFP17480 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms