Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NEFHP12036 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NEFHP12036 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NEFHP12036 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NEFHP12036 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms