Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNB1P11230 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRNB1P11230 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms