Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC166P0CW27 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC166P0CW27 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms