Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLA1P09884 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLA1P09884 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLA1P09884 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLA1P09884 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLA1P09884 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
POLA1P09884 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
POLA1P09884 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms