Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GLI1P08151 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GLI1P08151 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms