Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAPNS1P04632 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms