Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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UBXN7O94888 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
UBXN7O94888 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBXN7O94888 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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