Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms