Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPFIA3O75145 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PPFIA3O75145 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms