Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
DUX1O43812 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DUX1O43812 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DUX1O43812 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms