Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SGTAO43765 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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