Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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MTSS1O43312 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MTSS1O43312 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MTSS1O43312 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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