Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PHF1O43189 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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