Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDAC3O15379 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDAC3O15379 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HDAC3O15379 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms