Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CTDSP2O14595 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTDSP2O14595 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms