Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E2F3O00716 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2F3O00716 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2F3O00716 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms