Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms