Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPDC1A2A3K4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPDC1A2A3K4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms