Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PRG3Q9Y2Y8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms