Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHKBQ9Y259 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms