Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HPS5Q9UPZ3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms