Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC12A4Q9UP95 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms