Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TTF2Q9UNY4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TTF2Q9UNY4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms